六月七日，内阁限定最后限定日期一过，应天巡防营冲进了贡院将以张浦为首的五十人驾走，随后大批环卫工人进入贡院清理遗留垃圾及标语，他们花了五天的时间才将被弄得面目全非的贡院清理干净。
北京江南会馆被查封，躲在里面谈事情的温体仁和钱谦益（俩人已被革职在家，偷偷入京为内阁名单活动，此次学运是互相利用一起策划的)一起带走，在家的几名御史被东厂请去喝茶、问话。
**过后，邸报刊发崇祯亲写的《党争猛于虎乎！》，痛批了一些人为了权利，是非不明、结党营私、相互勾结，今日是敌人、明日成朋友，将国家利益至于身外，进行道德绑架，其自身又没有任何道德底线的恶劣行为。
接连几日刊发了温体仁和钱谦益的一些贪污受贿、任人唯亲的奇闻密事，每件都证据确凿，让人无法反驳，两人的声誉自此一落千丈。
魏忠贤看到邸报当即派人查封了钱谦益在江南各地的财产，根本不等正式通报后再按律查抄；而且秘密监视风头很盛几位名士，如有童生聚会立马驱散或抓捕，根本不给你解释；更过分他那几个同党还给出规定:童生无辜聚会剥夺功名，以至“阉党”名声在江南更臭了。
朱由检没有将贡院绝食的那些学生关起来，被审查了几日后将他们送去了陕西的皇庄强制劳动教育，让他们去了解西北的实际情况，免得一天到晚不知天高地厚的瞎捣蛋。
他们当中一些人加入了后来对乌思藏的行动死在大明的边疆，一年后被朱由检赦免，有些留在了当地，有些回到老家继续参加科举考试，他们当中也有人后来在文学、农业、医学和牧业上取得不错成绩。
张浦回到江苏老家后还是加入了“复社”，参加了崇祯三年的科举考试一举中第，传为一时佳话，最后成了文学大家。
温体仁和钱谦益全家分别被发配到九原（包头）和呼和浩特推广儒学、教化牧民，几位御史则被发配到云贵推广儒学、感化山民。
那钱谦益到牧区竟然如鱼得水，混得风生水起，在六十岁高龄还娶了一名小部落的十四岁的小公主，夫妻两恩爱不已，经常双栖双飞，在草原传为佳话，吸引了无数大明风流儒士蜂拥前往草原各地教化当地民众。
朱由检快刀处理了京城的学子**，十日召开禁军各镇团以上军官会议。
六月中五镇被调往天津；四镇带着留在当地的一半俘虏回到北京；二镇被调往郑州，三镇被调往济南，这两镇携带全部装备南下在当地
皇庄补足兵源变成三旅制；六镇在保定与保定镇混编成三旅制后调往石家庄。
北京剩下一镇、四镇补足兵源后和天津调回北京的兵混编成三旅制一万八千人，两骑兵镇同样扩编成三旅制一万五千人，周遇吉带着骑二镇南下德州。
大同镇总兵满桂带一万骑兵南下太原，保定镇南下邯郸。
六月底内阁要求各地要求在一月内完成登记土地情况，逾期将按万历年间土地登记为准。
会试完成后，朱由检没去贡院评卷，约了宋应星、孙元化起身去了宛平，去视察哪里的重工业区建设问题。
崇祯一年六月下旬宛平城卢沟桥
朱由检现在已无心观看“卢沟晓月”的风景，宋应星的话给他打击很大，到现在他还没透过气来。
宋应星这货还在桥上喋喋不休的说道：“陛下！工坊区放在卢沟桥下游河段实在不合适；这个浑河之所以为浑河，是因为它会犯浑，在泸定桥以下多次泛滥成灾；特别是六、七月暴雨季节，上面的洪水汇集大量泥沙冲下来，到这河道比较平缓的地带泥沙沉积，河水蔓延，河堤很容易被冲垮。”
朱由检抹下额头上的冷汗，无奈的道：“那如何处理是好呢？”
宋应星指着卢沟桥北方，回道：“陛下，臣已将工坊区建在石景山碧霞元君庙附近（今首钢附近），臣的奏章已禀报过，难道陛下没看到？可能陛下太忙，请陛下赎臣未告之罪！”
他说着就要伏地磕头，朱由检自己疏忽出的错，怎能让下属承当，忙用手扶着他的胳膊说道：“这不怪你，你做得好。浑河这样难到没法驯服么？”
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